在膜生物反应器中，由于用超滤膜组件用途代替传统活性污泥工艺中的二沉池，可以进行高效的固液分离，克服了传统活性污泥工艺中出水水质不够稳定、污泥容易膨胀等不足，从而具有下列优点：

(1)能高效地进行固液分离，出水水质良好且稳定，可以直接回用;

(2)由于膜的高效截留作用，可使微生物完全截留在生物反应器内,使运行控制更加灵活稳定;

(3)生物反应器内能维持高浓度的微生物量，处理装置容积负荷高，占地面积省;

(4)有利于增殖缓慢的微生物如硝化细菌的截留和生长，系统硝化效率得以提高。

(5)膜-生物反应器一般都在高容积负荷、低污泥负荷下运行，剩余污泥产量低，降低了污泥处理费用;

(6)易于实现自动控制，操作管理方便。